BioBlender описание, скриншоты и видео

BioBlender — это программный пакет, созданный на основе программного обеспечения для 3D-моделирования с открытым исходным кодом.Блендер.

Биология работает в наномасштабе с объектами, невидимыми для человеческого глаза. С помощью BioBlender можно показать некоторые символы, населяющие наши клетки, на основе научных данных и высочайшего стандарта 3D-манипуляций. Ученые всего мира изучают белки на атомарном уровне и размещают информацию в публичном репозитории Protein Data Bank, где каждая молекула описана в виде списка входящих в нее атомов и их 3D-координат.

С помощью BioBlender пользователи могут работать с белками в трехмерном пространстве, отображая их поверхность в фотореалистичном виде, и разрабатывать движения белков на основе известных конформаций.

Файлы PDB можно загрузить из заданного пользователем каталога или загрузить непосредственно с сайта PDB (путем вставки кода PDB). Белок отображается в 3D (в виде атомов или молекулярной поверхности), и пользователь может рассчитать и визуализировать его поверхностные свойства, молекулярный липофильный потенциал и электростатический потенциал. Для движения белка BioBlender вычисляет промежуточные значения между двумя конформациями, используя Blender Game Engine. Программа выдает как промежуточные файлы PDB, так и визуализированные изображения в виде фильма.

BioBlender — это реализация Blender, свободно распространяемая, многоплатформенная, совместимая и поддерживаемая программа с открытым исходным кодом для 3D-анимации, визуальных эффектов и видеоигр.

Сочетание компьютерной 3D-графики, игрового движка и научных программ делает BioBlender полным инструментом для разработки движения белков и отображения особенностей их поверхности с использованием визуального кода, основанного на текстурировании и спецэффектах частиц. Таким образом можно показать физические и химические свойства молекулы в движении.

BioBlender является результатом сотрудничества, организованного группой SciVis в CNR в Пизе (Италия), между учеными разных дисциплин (биология, химия, физика, компьютерные науки) и