Cytoscape — это программная платформа с открытым исходным кодом для визуализации сложных сетей и их интеграции с атрибутивными данными любого типа. Доступно множество плагинов для различных проблемных областей, включая биоинформатику, анализ социальных сетей и семантический веб.
Cytoscape поддерживает множество вариантов использования в молекулярной и системной биологии, геномике и протеомике:
Загружайте наборы данных о молекулярных и генетических взаимодействиях во многих форматах
Проектирование и интеграция глобальных наборов данных и функциональных аннотаций
Установите мощные визуальные сопоставления этих данных
Выполняйте расширенный анализ и моделирование с помощью плагинов Cytoscape.
Визуализируйте и анализируйте созданные человеком наборы данных путей, такие как Reactome или KEGG.