DNAssist предоставляет интуитивно понятный единый интерфейс, в котором файлы последовательностей отображаются, редактируются и анализируются. Пользователь может настроить отображение в окнах редактора, выбрав шрифт, размер шрифта и длину строки. Последовательность анализируется простым переносом окна редактора наверх и выбором необходимого анализа из меню. Все анализы также могут быть выполнены на выбранной области последовательности в окне редактора. Щелчок правой кнопкой мыши откроет контекстно-зависимое всплывающее меню. Это дает пользователю удобный ярлык для большинства пунктов меню. Анализы, доступные на DNAssist, включают:
Преобразование последовательности ДНК между кольцевой и линейной формами
Преобразование ДНК в РНК или белковую последовательность
Преобразование РНК в ДНК или белковую последовательность
Трансляция последовательности ДНК в аминокислотную последовательность в одном, трех или всех шести кадрах
Поиск открытых рамок считывания (ORF) в последовательности ДНК
Поиск определенных шаблонов последовательности в последовательности (это позволяет использовать подстановочные знаки, несоответствия и пробелы)
Проведение рестрикционного анализа с определенным набором ферментов
Выполнение анализа промотора ДНК с указанными факторами транскрипции
Обнаружение сильных сигналов позиционирования нуклеосом в ДНК
Выполнение множественного выравнивания ДНК, РНК или белков
Получение молекулярной массы нуклеиновой кислоты или белка
Получение температуры плавления олигонуклеотида
Расчет pI белка
Расчет гидрофильного, гидрофобного или антигенного профиля белка
Получение молярного коэффициента поглощения и Е0,1% нуклеиновой кислоты или белка
Получение нуклеотидного или аминокислотного состава нуклеиновой кислоты или белка
DNAssist объединяет все эти функции в одном тесно интегрированном приложении для Windows.
Результат анализа отображается в окне результатов и может быть распечатан, сохранен на диск или скопирован и вставлен в сторонние приложения. Сохраненные или скопированные результаты сохраняют формат, в котором они были отображены.