JMicroVision был разработан для описания, измерения, количественной оценки и классификации компонентов всех видов изображений. Он имеет интуитивно понятный пользовательский интерфейс с мощными функциями и поддерживает очень большие изображения. JMicroVision содержит инструменты с разной степенью автоматизации для управления сложными и разнообразными изображениями.
Подобно микроскопу, он позволяет проводить динамическое наблюдение за образцом с возможностью комбинирования различных фокусов или режимов освещения (поляризованный свет, флуоресценция...). Более того, увеличительная линза и инструмент Multiview позволяют одновременно просматривать несколько изображений, каждое из которых имеет свой собственный коэффициент масштабирования, сохраняя при этом общее положение в центре.